伝説のポケモン・珍しいポケモン・貴重なポケモン
ジョウト地方で出会える伝説のポケモン
ライコウ・エンテイ・スイクン（レベル40）
ライコウ・エンテイは、エンジュシティのやけたとうイベント終了後、ジョウト地方の草むらを逃げ回ります。
タウンマップで居場所が確認できますが、すぐに場所を変えるので辛抱強く追いかけて回る必要があります。出会うとすぐ逃げようとするので、ゲットするのは簡単ではありません。一度減らしたHPなどは、再度遭遇したときにも引き継がれます。
スイクンは、シナリオ中に、タンバシティ上方面→スリバチ山出口付近（いあいぎり）→クチバシティ港付近→14番どうろ右下方面、で順に遭遇（いずれもバトルなし）後、25番どうろのカスミが居た高台でバトルができます（直前でレポートも可）。ここでもし倒してしまったとしても、「やけたとう」で再び出現します。
「くろいまなざし」を使うと、1ターンで逃げるポケモンに便利。「ほえる」を使ってきたときは、「あくび」などを使うと有効。エンティ・ライコウを捕まえるには30番どうろと31番道路を往復しながらポケギアのマップを見ながらさがすのがいいとの情報（視聴者提供）。
ホウオウ・ルギア（先に遭遇：レベル45、後に遭遇：レベル70）
シナリオ中（バッジ8個→エンジュシティの「まいこはん」イベント終了後）に、ハートゴールドなら「すずのとう」最上階でホウオウ、ソウルシルバーなら「うずまきじま」最深部でルギアに遭遇。
シナリオ中に遭遇できなかったほうは、ポケモンリーグ後、カントー地方のニビシティで街の右のほうの高台にいる老人に話しかけ、「ぎんいろのはね」（ハートゴールド）または「にじいろのはね」（ソウルシルバー）を貰い、ソウルシルバーなら「すずのとう」最上階でホウオウ、ハートゴールドなら「うずまきじま」最深部でルギアに遭遇。
ルギア、ホウオウはおぼえるわざが、「せいなるほのう」、「エアロブラスト」以外、おぼえるわざが同じです。
グラードン・カイオーガ・レックウザ（レベル50）
ハートゴールドではカイオーガ、ソウルシルバーではグラードンにしか出会えません。
オーキド博士にヒトカゲ・フシギダネ・ゼニガメ（レベル5）を貰ったあと、シナリオ冒頭でトゲピーのタマゴを貰った「ポケモンじいさん」の家（30番どうろ上方面）に入ると、「あいいろのたま」（ハートゴールド）または「べにいろのたま」（ソウルシルバー）が貰えます。どちらかを持っている状態で「うずもれのとう」に行くと出現。よりみち攻略チャート「うずもれのとう」をご覧ください。
レックウザに会うには、「うずもれのとう」で捕まえたグラードンとカイオーガの2匹（それ以外の方法でゲットしたのはNG。1つのシナリオで1匹しかゲットできないため、通信によって送る必要があります）をオーキド博士に見せると「もえぎいろのたま」が貰えるので、「うずもれのとう」に行けば登場します。
ディアルガ・パルキア・ギラティナ（レベル1）
映画で手に入れたアルセウスを手持ちの先頭にした状態で、「アルフのいせき」へ。（位置はタウンマップをご覧ください）
そのまま研究所の前に行くと所長が飛び出してきて、一緒にアルフのいせき内部に入ります。すると画面が3回反転し、3回目で「シントいせき」に飛びます。
3つのエンブレムから１つを選びます。シロナと遺跡に入る時は手持ちがアルセウス一匹だけでなくてはいけません。 それがディアルガ、パルキア、ギラティナです。シントに移っていきなり外（下）に行くと、山登り親父に山小屋に連れて行かれますが、ケーシィをもった爺さんがエスケープ勧める以外はシロナが案内してくれます。でも、山小屋のパソコンでアルセウス以外は預けないといけませんが。
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