ひがしのうみ（かいていどうくつ）
海に潜り、ナッパーズを追いかけよう。
マンタインを2匹（1匹は右上の部屋の中）キャプチャし、「きょうかワイヤー」を「きる4」×2でターゲットクリア。ドククラゲと対戦。
画面の指示に従い追いかけよう。
キングドラと対戦。真っ暗なエリアでは、上の出口に行くと最初からやり直しになってしまう。下の出口（出れません）のすぐ右側に小さな石碑があり、反応させます。
地上に自動浮上し、「ナナメむら」に自動移動。
「シクレレじま」の「シクレレのせきひ」へ戻ろう。移動するためのムクホークは「ブッカーおおはし」を渡ったところにいます。
シクレレじま（シクレレのせきひ）
ラティオスまたはラティアスを目撃。
石碑の左下にいるムクホークに乗り、追いかけよう。
ラティオスまたはラティアスをキャプチャしよう。
ラティオスまたはラティアスのサインを描いて登録すると、ミッションクリア！ （以後「ラティオス」としか記載されていませんが、主人公が「おんなのこ」の場合は「ラティアス」になります）
登録したサインを描いて、ラティオスを呼ぼう。
ラティオスを操縦し、すぐ南（下）の「ライウンじま」の「ライウンやまの あんうん」へ突入しよう。
暗雲にはスゴい雷が発生。
ラティオスを左右に操縦し、雷を避けながら着陸しましょう。
ライウンじま（ライウンやま）
新たなミッションがスタート。
ミッション「パープルアイを さがしだせ！」がスタート。進むと、ウリムー・ヒポポタスと対戦。進むと、イノムーと対戦。続いてマンムーと対戦。
道が「きかいのかべ」でふさがれているというメッセージ。
中央の右側の部屋にいるカバルドン、北（上）の右側の部屋にいるエレキブル、入口付近にいるライボルトをキャプチャし、カバルドンの「こわす4」で「きかいのかべ」をターゲットクリア。エレキブル・ライボルトの「でんき3」×2で「でんきのさく」をターゲットクリア。サンダースと対戦。
「てつのさく」があるというメッセージ。
「てつのさく」の下方向にいるマニューラをキャプチャし、「きる3」以上で「てつのさく」をターゲットクリア。マルマイン8匹と対戦。石碑にライコウのサインを描こう。サンダーがまもなく目覚めてしまう。レアコイル2匹・ジバコイルと対戦。続いてレントラー2匹と対戦。
パープルアイのメタグロスと対戦。
勝利するとミッションクリア！ しかし何者かが現れサンダーが目覚めてしまう。再び「オブリビアいせき」へ。
攻略フローチャートの続きは攻略フローチャート17
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